Az iskola 1994. március 1-től viseli Herman Ottó természettudós, polihisztor nevét.A Radnóti Miklós utcai intézmény kiemelt célja a környezeti nevelés, évek óta környezeti nevelési bázisiskolaként működik, 1999 szeptembere óta oktatóközpont. Az iskola rendelkezik Környezeti Nevelési Programmal, tantárgyanként kidolgozott feladatrendszerrel, s 1999 szeptemberétől tagja a Környezet és Természetvédelmi Oktatóközpontok Országos Szövetségének.A XIII. kerületben elsőként indította el 1987-ben az erdei iskola programot, és mostanra hagyomány, hogy minden évfolyam megy erdei iskolába, ahol a környezeti nevelés mellett a közösségépítés kap hangsúlyos szerepet. Az évenkénti két „Zöld napi” program is a környezeti nevelést szolgálja.Az iskola három alkalommal nyerte el az Ökoiskola címet.A Herman Ottó Tagiskolában kiemelten kezelik az első négy év alapozó munkáját, fontos feladat az alapkészségek kialakítása, fejlesztése. Azoknak a képességeknek, személyiségjegyeknek a fejlesztését tartják fontosnak, amelyek a későbbiekben a továbbhaladás szempontjából elengedhetetlenek. Emellett hangsúlyt kap az egészséges életmódra és a környezettudatos magatartásra nevelés. Minden alsó tagozatos gyermek testnevelés óra keretében szervezett úszásoktatásban részesül.Ahol igény van rá, már az alsó tagozaton a választható tantárgyak között szerepel az angol nyelv és az informatika oktatása.Nyáron angol és kézműves táborokat szerveznek, februárban sítáborba mehetnek a tanulók.Az iskola 2007. július 1-től a Gárdonyi Géza Általános Iskola tagiskolájává vált.A Herman Ottó Tagiskola célja, hogy olyan tanulók hagyják el a nyolcadik osztályt, akik értik, szeretik és védik a környezetüket, akik toleránsak és együttműködők, kreatívak és megtalálják helyüket a közösségben.